Parámetros de Python són iguales a los parámetros largos (--parámetro) de Terminal, si no especificado de otra manera. Banderas son parámetros de verdadero o falso (True/False) en Python. El manuál para cualquier modulo de gget se puede llamar desde la Terminal con la bandera -h --help.

gget setup 🔧

Función para instalar/descargar dependencias de terceros para un módulo de gget.

Nota: Algunas dependencias (por ejemplo, cellxgene-census) pueden no ser compatibles con las versiones más recientes de Python. Si encuentras errores durante la instalación, intenta usar un entorno con una versión anterior de Python.

Parámetro posicional
module
Módulo gget para el que se deben instalar las dependencias.

Por ejemplo

gget setup alphafold

# Python
gget.setup("alphafold")

→ Instala todas las dependencias de terceros (modificadas) y descarga los parámetros del algoritmo (~4 GB) necesarios para ejecutar gget alphafold.